Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms