Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Prpf8Q99PV0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms