Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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