Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms