Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprtQ99M80 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprtQ99M80 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprtQ99M80 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PtprtQ99M80 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprtQ99M80 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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