Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms