Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms