Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prpf19Q99KP6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prpf19Q99KP6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms