Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn2aQ99KJ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms