Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Smim11aQ99J19 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim11aQ99J19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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