Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csde1Q91W50 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms