Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q8VDP2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8VDP2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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