Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn4Q8VCH8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubxn4Q8VCH8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn4Q8VCH8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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