Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms