Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top1mtQ8R4U6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Top1mtQ8R4U6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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