Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim29Q8R2Q0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim29Q8R2Q0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim29Q8R2Q0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim29Q8R2Q0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim29Q8R2Q0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim29Q8R2Q0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms