Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyripQ8K3I4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MyripQ8K3I4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms