Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vrk3Q8K3G5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vrk3Q8K3G5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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