Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms