Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gtf3c1Q8K284 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gtf3c1Q8K284 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gtf3c1Q8K284 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gtf3c1Q8K284 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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