Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lyrm4Q8K215 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lyrm4Q8K215 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms