Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Setd1bQ8CFT2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd1bQ8CFT2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Setd1bQ8CFT2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Setd1bQ8CFT2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd1bQ8CFT2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms