Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
AmtQ8CFA2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms