Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms