Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Klhl11Q8CE33 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Klhl11Q8CE33 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Klhl11Q8CE33 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl11Q8CE33 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms