Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pramef8Q8CE24 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pramef8Q8CE24 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef8Q8CE24 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms