Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slfn5Q8CBA2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slfn5Q8CBA2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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