Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Phtf2Q8CB19 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Phtf2Q8CB19 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Phtf2Q8CB19 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phtf2Q8CB19 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms