Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnot2Q8C5L3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms