Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf428Q8C1M2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf428Q8C1M2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf428Q8C1M2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf428Q8C1M2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms