Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gtf3c4Q8BMQ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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