Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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