Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cyp4f39Q8BGU0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cyp4f39Q8BGU0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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