Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms