Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Liat1Q810M6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms