Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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