Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q80Y73 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q80Y73 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q80Y73 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q80Y73 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms