Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms