Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1cQ7TSF0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms