Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tnfsf18Q7TS55 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tnfsf18Q7TS55 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Tnfsf18Q7TS55 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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