Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actn1Q7TPR4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms