Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdcl2Q78Y63 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdcl2Q78Y63 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms