Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ubfd1Q78JW9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubfd1Q78JW9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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