Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rph3alQ768S4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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