Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cspg5Q71M36 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cspg5Q71M36 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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