Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx55Q6ZPL9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx55Q6ZPL9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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