Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms