Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp49Q6P9L4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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