Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrp12Q6P5B0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms