Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms